Mulai berkibar di belantika sepak bola profesional Tanah Air pada 10 September 2016, Kompetisi bertajuk Go-Jek Traveloka Liga 1 2017 jadi kompetisi sepak bola profesional resmi perdana bagi Bhayangkara FC. 

Usai keluar sebagai juara di musim kompetisi 2017 dan finis di peringkat 3 di musim 2018, langkah Bhayangkara FC pada musim 2019 penuh dengan tantangan. Mulai dari harus menjalani laga kandang di Stadion Patriot Candrabhaga, Bekasi, Jawa Barat, hingga berujung pergantian sosok pelatih kepala.

Pada kompetisi BRI Liga 1 musim 2021/2022, Bhayangkara FC melanjutkan tradisi sebagai klub papan atas Indonesia. Yaitu dengan mengakhiri persaingan di urutan ketiga klasemen akhir. Klub berjuluk The Guardian berada di bawah Bali United FC dan Persib Bandung.